Pour se protéger, les plantes peuvent adapter leur activité biologique aux conditions de milieu.
Par exemple, en hiver, les plantes ont des organes spécialisés qui assurent leur survie durant la mauvaise saison, tel que les bourgeons. Ceux-ci sont protégés par des écailles et traversent l’hiver en vie ralentie tout comme les arbres lorsque l’automne arrive.
Les plantes se protègent aussi des prédateurs à l’aide de défenses chimiques (libération de molécules toxiques, répulsives…) ou de défenses morphologiques (épines, cuticule épaisse…).
Ces défenses peuvent être une partie constitutive de la plante notamment pour les défenses morphologiques mais elles peuvent aussi être induites par une agression : lorsqu’une plante se fait attaquer, le reste de la plante peut synthétiser une substance toxique visant à éliminer le prédateur. Il s’agit de signaux d’alerte.
Parfois même, les plantes se défendent en attirant autour d’elle des prédateurs d’herbivores.